直屬單位

• 圖書館 圖書館
• 醫藥衛生分析中心 中心實驗樓2層
• 信息通訊中心 行政一號樓西配樓1層
• 學報（醫學版）編輯部 行政二號樓1層
• 中國藥物依賴性研究所 藥研二所樓
• 醫學教育研究所 行政一號樓2層
• 實驗動物科學部 教育工會東側
• 中國衛生發展研究中心 樹華樓
• 醫學信息學中心 行政一號樓3層
• 醫學繼續教育學院 行政一號樓西配樓2層
• 北京大學健康醫療大數據國家研究院 有朋館
• 北京大學醫學部精準醫療多組學研究中心 北京市中關村生命科學園科學園路8號
• 北京大學全國醫學教育發展中心 行政一號樓2層
• 檔案館 圖書館一層東北角
• 北京大學跨學部生物醫學工程系 躍進廳4層
• 北京大學醫學部醫學技術研究院 病理樓2層
• 北京大學國際癌癥研究院